Glossary entry

English term or phrase:

rescue, rescue arm

Russian translation:

сохранение / линия клеток с сохраненным/введенным геном [таким-то]

Added to glossary by Natalie
    The asker opted for community grading. The question was closed on 2018-06-25 16:54:08 based on peer agreement (or, if there were too few peer comments, asker preference.)
Jun 22, 2018 12:17
5 yrs ago
2 viewers *
English term

rescue, rescue arm

English to Russian Medical Genetics
Percent growth of HCT116 wt and HCT116 MTAP-/- cells upon PRMT5 knockdown (+dox), with or without PRMT5 wt or R368A mutant rescue.

PRMT5 knockdown with doxycycline-inducible shRNA led to more complete growth reduction in cells with MTAP deletion than in MTAP WT cells. Expression of an shPRMT5-resistant PRMT5 cDNA in the MTAP-null cells rescued growth inhibition upon endogenous PRMT5 knockdown, while expression of catalytically-dead R368A PRMT5 mutant cDNA did not.

we performed expanded in vivo study with a wild type MAT2A rescue arm of shMAT2A; growth inhibition was rescued in the xenograft expressing a MAT2A cDNA that was resistant to the MAT2A shRNA.
Change log

Jun 25, 2018 18:22: Natalie Created KOG entry

Discussion

Igor Andreev Jun 22, 2018:
по сути получается "контрольный эксперимент с восстановлением исходного фенотипа"
Igor Andreev Jun 22, 2018:
How can I rescue the phenotype of my gene after knockdown using shRNA (to show the specificity of the shRNA)?

You can rescue the phenotype of the gene by over-expression of a cDNA or introducing large amounts of protein into the cell to out-compete the knockdown.
http://dharmacon.horizondiscovery.com/resources/faqs/how-res...
Igor Andreev Jun 22, 2018:
не знаю, я все же склонен к какому-то аналогу "положительного контроля", поскольку суть в подтверждении эффекта РНК-интерференции путем его снятия

Вместо внесения может быть и индуцированная сверхэкспрессия того же гена
Rescue experiments are always tricky but I'd be concerned about reviewing something which suddenly switched to an overexpressing line with transient knockdown when you have a stable knockdown already available which you simply need to re-express your protein in.
https://www.researchgate.net/post/Can_anyone_help_me_regardi...


https://www.researchgate.net/post/Rescue_Experiment_to_exclu...
Natalie Jun 22, 2018:
Так и здесь ведь внесение - типа donation
Igor Andreev Jun 22, 2018:
и как все-таки с rescue arm обойтись

The rescue arm of knock-down and add back experiments would
be most simply performed...

Не дочитал )
там помощь скорее относится к donation
Natalie Jun 22, 2018:
А-а, дошло :-) Ну да, ген в данном случае вносится, но все равно ведь "growth inhibition was rescued" - ингибирование роста сохранялось

Вот нашла еще, что народ употребляет в аналогичных случаях слово "помощь":
plasmid donation (rescue), homologous drift - плазмидная “помощь”. Процесс перемещения неконъюгативных плазмид <non-conjugative plasmid> из клетки-донора в клетку-реципиент...
http://wsab-forest.sbras.ru/attachments/article/19/anglrusbi...

Rescue arm - группа "помощи"? :-)
Igor Andreev Jun 22, 2018:
Я совершенно не оспариваю, что речь идет о сохранении фенотипа - способности к клеточному делению в случае компенсации экспрессии shRNA, подавляющей экспрессию MAT2A, внесением гена, не чувствительного к той самой shRNA.
Но не согласен с "сохранением гена".

И речь именно о контрольном эксперименте, подобном описанному на сайте термофишера, я привел ссылку на патент, краткая схема описана в легенде к рис. 5
Natalie Jun 22, 2018:
Не согласна. Ссылка на Термофишер - частный случай (вернее, один из множества). А в общем даже по той ссылке речь о сохранении фенотипа.

Или здесь, например: http://www.oxfordreference.com/view/10.1093/oi/authority.201...
The introduced wild-type gene sequences are said to “rescue” the mutant phenotype to normality.
Igor Andreev Jun 22, 2018:
rescue arm - что-то типа положительного контроля

The rescue arm of knock-down and add back experiments would
be most simply performed by introducing expression vectors
encoding cDNA with silent mutations preventing cleavage by
Cas9–sgRNA.
https://www.horizondiscovery.com/media/resources/Publication...
Igor Andreev Jun 22, 2018:
Доброй ночи, Натали, не совсем так.
shMAT2A это short hairpine RNA MAT2A, используемая для подавления экспрессии MAT2A и экспрессируемая клетками
wild type MAT2A rescue arm of shMAT2A - это вероятнее всего MAT2A cDNA that was resistant to the MAT2A shRNA (или клетки которые ее продуцируют), которая использована для проведения rescue experiment, необходимого, чтобы показать, что именно подавление экспрессии MAT2A приводит к прекращению деления клеток (growth inhibition)
https://patents.google.com/patent/WO2017096165A1/en

суть rescue experiment см. тут п.1
https://www.thermofisher.com/us/en/home/references/ambion-te...

Но на ум пока особо ничего гениального не приходит, возможно Вам приходилось сталкиваться
Простите, если несколько сумбурно к ночи

Proposed translations

3 hrs
Selected

сохранение / линия клеток с сохраненным геном [таким-то]

Например, wild type MAT2A rescue arm of shMAT2A - линия shMAT2A с сохраненным геном MAT2A дикого типа
Something went wrong...
4 KudoZ points awarded for this answer. Comment: "Natalie, спасибо большое за помощь!"
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search